El sector gestiona los recursos hídricos de forma sostenible con el fin de preservar y asegurar el equilibrio natural de los manantiales en calidad y cantidad. Por imperativo legal, la zona de captación (perímetro de protección concedido por las autoridades mineras a cada industria) ha de estar absolutamente protegida y cada empresa envasadora se responsabiliza de preservar y asegurar la pureza original del acuífero y de su entorno, que es uno de sus más preciados valores añadidos como producto alimentario. 

Por otro lado, el agua mineral es un recurso renovable y esto se debe, en gran media, a las buenas prácticas del sector en la correcta gestión del caudal de aprovechamiento concedido por las autoridades. Dicho caudal se calcula en base al balance hídrico de la zona y es totalmente respetado por la industria envasadora al no extraer más de lo establecido por la Administración. De esta manera la industria hace posible la recarga natural de los acuíferos. 

Para desarrollar esta correcta gestión, el sector debe poseer un claro conocimiento de la dinámica del acuífero, tanto desde el punto de vista espacial como temporal, conociendo bien el volumen de los recursos (entradas reales de agua) y las reservas (volumen total de agua almacenada), así como el tiempo de permanencia del agua en su interior.